IMTECH

虚拟现实帮助微生物研发

IMTECH是一个印度的微生物学研究和技术中心,它的科学家们在传统以及新兴领域实行综合研究,而且还有,微生物学、免疫学、生物信息学、蛋白质科学与工程和药物设计。IMTECH在生物信息学和结构生物学的研究侧重于硅胶和生物物理技术的多样性,比如分子模型、X射线晶体学、SAX和电子显微镜。

PYMOL

PYMOL是用户发起的一个开源基础的分子可视化系统。Srikrishna•萨勃拉曼尼亚( IMTECH的首席科学家)解释道:“我们的实验室专注于开发新的计算方法来研究蛋白质结构,通过进行进化分析,并进行家族/折叠蛋白质的分类。我们使用PyMOL来研究已经有很长一段时间了。能将开源的PyMOL与虚拟现实完全集成使我们选择VIRTAILIS的一个非常重要的因素, 因为PyMOL是我们的大多数学生使用的唯一的可视化工具,是因由于它的直观GUI和强大的命令行脚本的能力。”

Virtalis已经开发了属于自己的适用于PyMOL的软件者,它允许分子数据在立体三维中呈现并能与之互动。

一个大“惊叹 ”

Imtech已经安装Virtalis VR软件Enabler PyMOL和Virtalis ActiveWall虚拟现实(VR)系统。

“用户在使用ActiveWall配用使 PyMOL虚拟现实系统的第一反应总是一个大“哇”!” 萨勃拉曼尼亚表示。“我们现在有一个易于使用的、互动的平台,它可以使我们感兴趣的分子在3D中呈现。当ActiveWall和VR Enabler PyMOL安装时,作为高分子技术高端可视化平台的应用是非常明确的。一旦集成系统启动和运行,惊人的视觉冲击会使人肃然起敬,能够在一个大屏幕上看他们的结构数据,并能在与它们进行实时交互。“

ACTIVEWALL

Virtalis的 ActiveWall是沉浸式的,互动的三维可视化系统,也是全世界最畅销的虚拟现实系统。ActiveWall利用的是主动的立体视觉技术和特制的屏幕,专业电脑,Virtalis定制的软件和强大的投影仪。在ActiveWall范围内移动是靠使用追踪系统跟踪的。这个新增的功能可以根据用户在现场的位置和方向来改变视觉角度,以给人一种自然的和准确的关系和比例。手持控制器允许进一步增强沉浸式的体验,用户可以在虚拟世界里穿梭,实时选择和使用分子,以及做出动态决策。

给IMTECH带来的效益

萨勃拉曼尼亚表示,该系统的实用程序是这样的,研究人员可以使用它来交互式地呈现在原子层面生物大分子结构,允许进行详细的结构分析。除了作为一个特殊的研究环境,我们的ActiveWall也可以用来作为教学工具,向学生以及来自其他相关领域的合作者强调大分子的重要性。

Imtech目前使用其ActiveWall VR-enabled PyMOL使生物大分子在3D中呈现(特别是蛋白质),为了研究这些分子之间的相互作用和其他生物基团。该系统也被部署用于蛋白质结构的教学,因为它有助于学生了解生物大分子相互作用,如蛋白质-DNA的相互作用,或在特定情况下的多重耐药性。

萨勃拉曼尼亚总结说:“ActiveWall让小组讨论有了更多的互动,因为特定的蛋白质或高分子的微小细节被更清晰地放在了3D的大屏幕中。我们现在能更好地理解一个蛋白质的功能是如何在原子能级的交互作用下被调整的,而观众也可以在丰富的互动细节里看到这些大分子。当在讨论过程中我们需要的时候,手部跟踪系统给提供我们调整结构的能力,或着从多个角度去观看。总的来说,Virtalis ActiveWall促进了培养积极的讨论和参与的整体氛围。”

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